Analyse des mutations

Deux méthodes de séquençage sont principalement utilisées: séquençage selon la méthode de Sanger et séquençage de prochaine génération (Next Generation Sequencing = NGS).

Matériau
Des préparations de sections/blocs histologiques, des préparations cytologiques et des tissus frais peuvent être utilisés pour les deux méthodes.

Séquençage de prochaine génération (NGS)

De nos jours, la détection de toutes les mutations pertinentes est possible en peu de temps grâce au séquençage parallèle de plusieurs gènes sur l’ADN et l’ARN de la tumeur au moyen d’un séquençage à haut débit (appelé séquençage de prochaine génération ou NGS). Le NGS permet en particulier le séquençage ciblé de l’ADN et de l’ARN pour détecter simultanément les mutations, les variations du nombre de copies et les transcrits de fusion cliniquement pertinents. Il peut également être utilisé pour les petites biopsies à faible teneur en cellules tumorales. Cette méthode fournit des résultats fiables dans les diagnostics de routine et répond aux exigences actuelles en matière de stratification thérapeutique.

Séquençage selon la méthode de Sanger

Le séquençage selon la méthode de Sanger est considéré comme l’une des méthodes classiques de séquençage de l’ADN et permet de déterminer la séquence de base de courtes séquences d’un gène spécifique. Dans le cadre du diagnostic des tumeurs, les séquences d’ADN de patients malades sont comparées aux séquences d’ADN de personnes en bonne santé afin d’identifier les séquences d’ADN mutées dans la tumeur.